Pronto, resolvido o problema.
Realmente me enganei, tem sim como fazer o motor da Factor, acredito que tinha visto em outro fórum a impossibilidade disso. Quando levei no mecânico ele viu que realmente era o cilindro arranhado e optei por fazer a parte de cima mesmo. Desta vez levei em outra oficina do que a de costume (a que eu levava era a da própria Yamaha na minha cidade, mas desde a primeira vez que pedi para fazer uma revisão completa só trocaram o óleo, sendo que tinha mais coisa a ser visto). Aproveitei e fiz uma revisão completa nessa outra oficina, sendo até cobrado R$300,00 para isso, porém não me arrependo, rodei cerca de 200km e posso dizer que até aparenta ser outra moto de tanto que melhorou.